MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. viciae 3841 plasmid pRL9

Total Repeats: 807

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008379	CCG	2	6	1207	1212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_008379	ACG	2	6	2277	2282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_008379	CGT	2	6	2284	2289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_008379	TGCC	2	8	3748	3755	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5	NC_008379	TCC	2	6	3787	3792	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_008379	CGGC	2	8	3800	3807	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_008379	GTT	2	6	3861	3866	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008379	TGG	2	6	3898	3903	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008379	AAT	2	6	3997	4002	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008379	TCG	2	6	4023	4028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_008379	CGG	2	6	4061	4066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_008379	TC	3	6	4141	4146	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_008379	GCG	2	6	4154	4159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_008379	GGCA	2	8	4198	4205	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
15	NC_008379	TGA	2	6	4220	4225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008379	TGG	2	6	4230	4235	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008379	GAATC	2	10	5920	5929	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
18	NC_008379	GC	3	6	5979	5984	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_008379	CGC	2	6	6018	6023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_008379	CGCGG	2	10	6044	6053	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
21	NC_008379	CGG	2	6	6144	6149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_008379	CAG	2	6	6157	6162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_008379	CCA	2	6	6187	6192	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_008379	CAT	2	6	6317	6322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_008379	GAT	2	6	6332	6337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008379	GCC	2	6	6802	6807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_008379	ACTC	2	8	6831	6838	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_008379	ATTT	2	8	6958	6965	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008379	CTG	2	6	7009	7014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_008379	CA	3	6	7043	7048	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_008379	TG	3	6	8315	8320	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008379	ACG	2	6	8435	8440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_008379	GCC	2	6	8452	8457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_008379	GAA	2	6	8563	8568	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008379	TCGA	2	8	8571	8578	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_008379	CGA	2	6	8657	8662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_008379	TCG	2	6	8704	8709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_008379	CCG	2	6	8710	8715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_008379	GCT	2	6	8723	8728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_008379	G	6	6	8815	8820	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
41	NC_008379	GCTC	2	8	8834	8841	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
42	NC_008379	CGAG	2	8	8860	8867	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
43	NC_008379	CCT	2	6	8868	8873	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_008379	AGC	2	6	8995	9000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_008379	CGC	2	6	9064	9069	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_008379	CGA	3	9	9860	9868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_008379	GAC	2	6	9872	9877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_008379	GCC	2	6	9886	9891	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_008379	TGC	2	6	9965	9970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_008379	CATC	2	8	9989	9996	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_008379	GC	4	8	10014	10021	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52	NC_008379	GAT	2	6	10044	10049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_008379	TTG	2	6	10686	10691	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_008379	TCG	2	6	15973	15978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_008379	GCC	2	6	16041	16046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_008379	GAG	2	6	16047	16052	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_008379	CGA	2	6	16073	16078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_008379	CGA	2	6	19694	19699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_008379	CAA	2	6	19765	19770	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_008379	CCG	2	6	19793	19798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_008379	CCG	2	6	22626	22631	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_008379	CG	3	6	22662	22667	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63	NC_008379	GC	3	6	22672	22677	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_008379	GC	3	6	23266	23271	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
65	NC_008379	ACG	2	6	23280	23285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_008379	CAT	2	6	23291	23296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_008379	GC	3	6	23337	23342	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
68	NC_008379	CAA	2	6	23857	23862	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_008379	GCGA	2	8	23867	23874	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
70	NC_008379	GGC	2	6	23882	23887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_008379	CGTT	2	8	23910	23917	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
72	NC_008379	TCA	2	6	23998	24003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_008379	TCCTG	2	10	24094	24103	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
74	NC_008379	CCG	2	6	24112	24117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_008379	CCTT	2	8	25542	25549	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_008379	GGC	2	6	25624	25629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_008379	ATG	2	6	25709	25714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_008379	GGAA	2	8	25761	25768	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_008379	TCAT	2	8	26178	26185	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_008379	CCA	2	6	26194	26199	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_008379	GTT	2	6	26262	26267	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_008379	AC	3	6	27114	27119	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_008379	TCT	2	6	27217	27222	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_008379	CGT	2	6	27223	27228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_008379	CGA	3	9	27229	27237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_008379	GCG	2	6	27941	27946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_008379	CGT	2	6	27955	27960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_008379	GC	3	6	28078	28083	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
89	NC_008379	GCC	2	6	28131	28136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_008379	GCC	2	6	28141	28146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_008379	TCA	2	6	28148	28153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_008379	AACA	2	8	28163	28170	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_008379	GCA	2	6	29275	29280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_008379	CGC	3	9	29285	29293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_008379	GCG	2	6	29297	29302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_008379	CAG	3	9	29321	29329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_008379	ATT	2	6	29355	29360	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_008379	TCC	2	6	29450	29455	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_008379	GCC	2	6	29472	29477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_008379	CGAT	2	8	29486	29493	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
101	NC_008379	TCG	2	6	29509	29514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_008379	TCA	2	6	29574	29579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_008379	CAT	2	6	29604	29609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_008379	CTC	2	6	30491	30496	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_008379	CAT	2	6	30506	30511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_008379	GCC	2	6	30524	30529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_008379	TCC	2	6	30537	30542	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_008379	CGC	2	6	30561	30566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_008379	CAT	2	6	30583	30588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_008379	GGAT	2	8	30701	30708	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_008379	CGC	2	6	30748	30753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_008379	CCT	2	6	30871	30876	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_008379	CGG	2	6	30901	30906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_008379	CTTG	2	8	34000	34007	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
115	NC_008379	CGGG	2	8	34052	34059	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
116	NC_008379	TGA	2	6	34252	34257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_008379	GCC	2	6	34272	34277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_008379	TCG	2	6	34322	34327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_008379	TCC	2	6	34375	34380	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_008379	GTT	2	6	34424	34429	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_008379	TCT	3	9	34472	34480	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_008379	CAGCC	2	10	34519	34528	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
123	NC_008379	GGC	2	6	36171	36176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_008379	ATCA	2	8	36739	36746	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
125	NC_008379	ACG	2	6	36752	36757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_008379	TTC	2	6	36913	36918	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_008379	CGCC	2	8	36924	36931	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
128	NC_008379	GCCG	2	8	37001	37008	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
129	NC_008379	GCA	2	6	37110	37115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_008379	GCG	2	6	37120	37125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_008379	CG	3	6	37128	37133	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
132	NC_008379	ACG	2	6	37203	37208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_008379	CCG	2	6	37209	37214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_008379	ATC	2	6	37254	37259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_008379	TCGGCC	2	12	37284	37295	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
136	NC_008379	CCA	2	6	37300	37305	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
137	NC_008379	TTC	2	6	37331	37336	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_008379	GCG	2	6	37448	37453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_008379	CCG	2	6	37488	37493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
140	NC_008379	AGA	2	6	37501	37506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_008379	CGGG	2	8	37515	37522	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
142	NC_008379	TCG	2	6	37583	37588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_008379	TCT	2	6	37676	37681	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_008379	GAC	2	6	37687	37692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_008379	TGC	2	6	37720	37725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_008379	GC	3	6	37724	37729	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
147	NC_008379	TTGC	2	8	37739	37746	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
148	NC_008379	CGG	2	6	37752	37757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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156	NC_008379	CGG	2	6	39713	39718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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183	NC_008379	CGC	3	9	42744	42752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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273	NC_008379	CAG	2	6	67528	67533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
274	NC_008379	AG	3	6	67532	67537	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
275	NC_008379	CCGG	2	8	67538	67545	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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279	NC_008379	GGC	2	6	68679	68684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
280	NC_008379	GCA	2	6	68698	68703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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282	NC_008379	TCCC	2	8	69601	69608	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
283	NC_008379	TGC	2	6	69798	69803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
284	NC_008379	CTAT	2	8	69830	69837	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
285	NC_008379	ATC	2	6	69858	69863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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287	NC_008379	ATGCG	2	10	70044	70053	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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420	NC_008379	TTCT	2	8	148512	148519	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
421	NC_008379	TTTCCG	2	12	148771	148782	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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423	NC_008379	CT	3	6	148923	148928	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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